Reportar bugs e sugerir melhorias
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em um dos repositórios GitLab abaixo, dependendo do problema.
Antes de postar, verifique se o que você quer relatar, perguntar ou propor já não está num issue aberto
.
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Issues para software
Issues para o pacote do R
Issues para este site de documentação
Colabore com o desenvolvimento, traduções de idiomas e documentos
Esperamos que este projeto cresça de forma colaborativa, necessário para o seu desenvolvimento e utilização no longo prazo. Portanto, colaboradores são bem-vindos para ajudar a corrigir e melhorar o OpenDataBio. A lista de problemas ou melhorias é um lugar para começar a saber o que é necessário fazer. Você pode também contribuir com Tutorias, melhorando a documentação.
As seguintes diretrizes são recomendadas se você deseja colaborar:
- Comunique-se com o administrador do repositório OpenDataBio indicando em quais questões deseja trabalhar e junte-se à equipe de desenvolvimento.
- Faça um
Fork
do repositório - Boa prática criar um
branch
para guardar suas modificações ou adições - Quando estiver satisfeito com os resultados, faça uma solicitação de
pull-request
ao mantenedor do projeto para revisar sua contribuição e mesclá-la com o código do repositório. Consulte a Ajuda do GitLab para obter mais informações sobre pull requests.
Diretivas de programação
- Use a instalação do docker para desenvolvimento, que compartilhada entre todos os desenvolvedores facilita a depuração. A biblioteca Laravel-Datatables é incompatível com
php artisan serve
, então este comando não deve ser usado. - Este software deve aderir ao Controle de Versão Semântico, a partir da versão 0.1.0-alpha1. O pacote R complementar e a Documentação (este site) devem seguir um esquema de controle de versão semelhante. Ao alterar a versão, uma tag de lançamento (release) deve ser criada com a versão antiga.
- Todas as variáveis e funções devem ser nomeadas em Inglês, com as entidades e campos relacionados ao banco de dados sendo nomeados no singular. Todas as tabelas (quando apropriado) devem ter uma coluna “id” e as chaves estrangeiras devem fazer referência à tabela base com o sufixo “_id”, exceto em casos de autojunções (como “taxon.parent_id”) ou chaves estrangeiras polimórficas. O id de cada tabela tem tipo INT e deve ser autoincrementado.
- Use a classe laravel migration para adicionar qualquer modificação à estrutura do banco de dados. A migração deve incluir, se aplicável, a manipulação de dados existentes, permitindo upgrades.
- Use camelCase para métodos (ou seja, relacionamentos) e snake_case para funções.
- Documente o código com comentários e crie páginas de documentação neste site, se necessário.
- Deve haver uma estrutura para armazenar quais plugins estão instalados em uma determinada versão do banco de dados quais são as versões de sistema compatíveis.
- Este sistema usa o Laravel Mix para compilar o código SASS e JavaScript usado. Se você adicionar ou modificar esses arquivos, utilize
npm run prod
depois de fazer qualquer alteração nesses arquivos.
Colabore com a documentação
Tutoriais para lidar com tarefas específicas são bem vindos!
Para criar um tutorial:
Fork
o repositório de documentação. Ao clonar este repositório ou do seu fork inclua a opção de submódulo para obter também o repositório de tema Docsy incluído. Você precisará de Hugo para executar este site em seu localhost.- Crie um
branch
para confirmar suas modificações ou adições - Adicione seu tutorial:
- Crie uma pasta dentro de
contents/{lang}/docs/Tutorials
usando kebab-case para o nome da pasta. Ex.primeiro-tutorial
- Você pode criar um tutorial em um único idioma ou em vários idiomas. Basta colocá-lo na pasta correta
- Dentro da pasta criada, crie um arquivo chamado
_index.md
e crie o conteúdo de markdown com seu tutorial. - Você pode começar copiando o conteúdo de um tutorial já incluído ou veja a documentação do Docsy
- Quando estiver satisfeito com os resultados, faça uma solicitação de pull para pedir ao mantenedor do projeto para revisar sua contribuição e mesclá-la com o repositório. Consulte a Ajuda do GitLab para obter mais informações sobre o uso de solicitações pull.
Colabore com traduções
Você pode ajudar com as traduções da interface do aplicativo ou deste site com a documentação. Se quiser ter um novo idioma para sua instalação, compartilhe sua tradução, criando um pull request com os novos arquivos.
Novo idioma para a interface da web:
- faça um fork e crie um branch para o repositório principal
- crie uma pasta para o novo idioma usando o Código ISO 639-1 dentro da pasta
resources/lang
cd opendatabio
cd resources/lang
cp en es
- traduza todos os valores para todas as variáveis dentro de todos os arquivos na nova pasta (pode usar a tradução do google para começar, apenas certifique-se de que os nomes das variáveis não sejam traduzidos, caso contrário, não funcionará).
- adicione o idioma ao array em
config/languages.php
- adicionar o idioma à tabela de languages do banco de dados criando uma migração laravel
- solicite um pull request
Novo idioma para o site de documentação
- faça um fork e crie um branch para o repositório de documentação
- crie uma pasta para o novo idioma usando o Código ISO 639-1 dentro da pasta
content
bash
cd opendatabio.gitlab.io
cd content
cp pt es
- verifique todos os arquivos dentro da pasta e traduza onde necessário (pode usar a tradução do google, apenas certifique-se de traduzir apenas o que pode ser traduzido)
- Veja se funciona bem na sua máquina local (precisa installar Hugo e servir digitando
hugo serve
na pasta do site, que ficará visível pelo navegador no endereço http://localhost:1313/. - empurre para o seu branch e faça um pull request
Relações polimóficas
Algumas das relações dentro da OpenDataBio são mapeadas usando Relações polimórficas. Elas são indicadas em um modelo por ter um campo terminando em _id
e um campo terminando em _type
. Por exemplo, todos os Objetos Centrais podem ter Medições, e essas relações são estabelecidas na tabela measurements pelas colunas measured_id
e measured_type
, o primeiro armazenando a id do modelo relacionado, o segundo é a classe do modelo medido em strings como ‘App\Models\Individual’, ‘App\Models\Voucher’, ‘App\Models\Taxon’, ‘App\Models\Location’.
Imagens do modelo conceitual
A maioria das figuras para explicar o modelo de dados foram geradas usando Laravel ER Diagram Generator, que permite mostrar todos os métodos implementados em cada modelo e não apenas os links diretos da tabela:
Para gerar essas figuras, um comando personalizado php artisan
foi gerado. Esse commando está definido no arquivo app/Console/Commands/GenerateOdbErds.php
.
Para atualizar as figuras siga os seguintes passos:
- As figuras são configuradas no arquivo
config/erd-generator-odb.php
. Existem muitas opções adicionais para personalizar as figuras alterando ou adicionando variáveis graphviz ao arquivoconfig/erd-generator-base.php
. - O comando personalizado é
php artisan odb: erd {$ model}
, onde model é a chave dos arrays emconfig / erd-generator-odb.php
, ou a palavra" all “, para regenerar todas as figuras doc.`bash cd opendatabio fazer ssh php artisan odb: erd all
` - As figuras serão salvas em
storage / app / public / dev-imgs
- Copie as novas imagens para a pasta do site de documentação. Eles precisam ser colocados em
contents / {lang} / concepts / {subfolder}
para todos os idiomas e nas respectivas subpastas.